Правила функціонування ЕСОЗ визначаються законами, постановами та наказами, зокрема: 

• Законом України “Про державні фінансові гарантії медичного обслуговування населення”;

• Постановою Кабінету Міністрів України №411 “Деякі питання електронної системи охорони здоров’я” від 25 квітня 2018 року; 

• Наказом МОЗ №503 “Про затвердження Порядку вибору лікаря, який надає первинну медичну допомогу, та форми декларації про вибір лікаря, який надає первинну медичну допомогу” від 19 березня 2018 року;

• Наказом МОЗ №586 “Про затвердження Порядку направлення пацієнтів до закладів охорони здоров’я та фізичних осіб - підприємців, які в установленому законом порядку одержали ліцензію на провадження господарської діяльності з медичної практики та надають медичну допомогу відповідного виду” від 28 лютого 2020 року;

• Наказом МОЗ №587 “Деякі питання ведення Реєстру медичних записів, записів про направлення та рецептів в електронній системі охорони здоров'я” від 28 лютого 2020 року.